13691255250 发表于 2020-5-29 22:14:30

求助!小白求问怎么用Python来寻找大量的化学反应式中的环路

我现在有一个Excel,里面有上百的化学方程式,
大概这种形式
A+B=C+D
C=E+F
F+G=A+H
...
可以看到存在A-C-F-A的化学反应环路
求问各路大神,怎么用Python在上百个错综复杂的反应中,找出如上存在的环路?

如有大神解答,愿以酬金奉上

13691255250 发表于 2020-5-29 22:17:19

第一次用这个论坛,怎么设置酬金呀,要是有大神解答,可以直接WX联系

Twilight6 发表于 2020-5-29 22:19:07

13691255250 发表于 2020-5-29 22:17
第一次用这个论坛,怎么设置酬金呀,要是有大神解答,可以直接WX联系

不一定用赏金,只要你描述好问题,态度诚恳,自然会有鱼油为你解答

java2python 发表于 2020-5-29 22:19:44

没明白题目意思:
什么叫环路,
A+B=C+D
C=E+F
F+G=A+H
只要反应式左侧中有A,然后一堆推导后,反应式的右侧中有A,就算环路?可实际,这需要别的元素加入,道理上
a+b=c+d
c+d=e+f
e+f=a+b
这样才叫环路,可实际也是不可能的,因为能反应,意味着能量释放,从能量守恒角度来说,这条路走不通的

青出于蓝 发表于 2020-5-29 22:27:13

酬金可能是等级不够~~

13691255250 发表于 2020-5-29 22:34:04

java2python 发表于 2020-5-29 22:19
没明白题目意思:
什么叫环路,
A+B=C+D


我主要是想找出,一系列反应中,某一个物质A,经历了n个方程式后,又回到原来的形态,比如A变成了C,C又变成了F,F又变成了A

糖逗 发表于 2020-5-29 22:45:41

感觉这是个递归问题可能还涉及到图(数据结构中有关于找图中环的问题)

1q2w3easxz 发表于 2020-5-30 11:23:08

初一表示好懵

java2python 发表于 2020-5-30 12:16:50

本帖最后由 java2python 于 2020-5-30 12:24 编辑

#反应方程式
classChem_equation:
    def __init__(self,left,right):
      self.left = left
      self.right = right
    #打印方程式:a+b=c+d
    def get_equation(self):
      chem_equ = ""
      for l in range(0,len(self.left)):
            chem_equ = chem_equ + self.left + "+"
      chem_equ = chem_equ + "="
      for r in range(0,len(self.right)):
            chem_equ = chem_equ + self.right + "+"
      chem_equ = chem_equ
      return chem_equ
      
#某元素是反应物的词典:(0)a+b=c+d (7)a+m=k+l 那么map中就有一条{'a':}
class React_map:
    react_element = {}

    @staticmethod
    def ele_in_equation_left(chem_list):
      for c in range(0,len(chem_list)):
            chem = chem_list
            left = chem.left
            for l in range(0,len(left)):
                element = React_map.react_element.get(left)
                if element == None:
                  React_map.react_element.update({left:})
                else:
                  element.append(c)

#搜索节点:
class Srh_node:
    def __init__(self,equation_no,equafrom,routefrom):
      self.equation_no = equation_no       #方程式编号
      self.equafrom = equafrom             #本节点来自于方程式编号
      self.routefrom = routefrom         #本节点来自于搜索队列号

#初始化反应方程式列表
def init_equation_list():
    chem_list = []
    chem_list.append(Chem_equation(['a','b'],['c','d']))
    chem_list.append(Chem_equation(['c'],['e','f']))
    chem_list.append( Chem_equation( ['f','g'],['a','h']))
    chem_list.append(Chem_equation(['c','g'],['d','h']))
    chem_list.append(Chem_equation(['d'],['m','n']))
    chem_list.append(Chem_equation(['m','g'],['b','x']))
    chem_list.append(Chem_equation(['s','t'],['u','v']))
    return chem_list

#主程序
def main():
    chem_list = init_equation_list()
    React_map.ele_in_equation_left(chem_list)
    #debug :打印方程式列表
    print("#################方程式列表")
    for i in range(0,len(chem_list)):
      print("<%d>%s" % (i,chem_list.get_equation()))
    #debug test:打印元素在左侧的方程式:元素,方程式列表
    print("#################元素在左侧的方程式:元素,方程式列表")
    for item in React_map.react_element.items():
      print(item,item)

    #搜索开始
    chem_list_visted = {}    #已访问节点
    routes = []       #搜索路线,列表中保存搜索节点
    circles = []      #构成环路路线:保存字符串:方程式0->方程式4->方程式5->方程式0
    srh_node = Srh_node(0,0,0)
    routes.append(srh_node)
    #上次搜索指针,当前搜索指针(指向搜索队列)
    # 搜到的节点加入一个,当前搜索指针就加1,当前搜索指针>上次搜索指针意味搜索没有结束
    last_routes_ptr = 0
    cur_routes_ptr = 1
    #第一次从初节点开始,不断发展,知道发展不出新节点
    while cur_routes_ptr > last_routes_ptr:
      cur_routes_ptr_tmp = cur_routes_ptr
      #从上次搜索指针->当前搜索节点,也就是上次新发展的节点再发展
      for i in range(last_routes_ptr,cur_routes_ptr_tmp):
            #从队列取出一个节点(方程式)
            srh_node = routes
            #该方程式取出右侧元素,对所有右侧元素循环
            right = chem_list.right
            for r in range(0,len(right)):
                #找出右侧元素在方程式左侧的方程式
                equations = React_map.react_element.get(right)
                if equations != None:
                  #把这些方程式中没有访问过的,全部加入队列
                  for e in range(0,len(equations)):
                        if chem_list_visted.get(equations) == None:
                            if routes.equation_no == equations:
                              #回到初始节点
                              circle_node = srh_node
                              route_str = "->方程式" + str(circle_node.equation_no) + "->方程式0"
                              while circle_node.equafrom != routes.equation_no:
                                    circle_node = routes
                                    route_str = "->方程式" + str(circle_node.equation_no) + route_str
                              route_str = "方程式0" + route_str
                              circles.append(route_str)
                            else:
                              #非初始节点,且没有被访问过
                              chem_list_visted.update({equations:0})
                              sub_node = Srh_node(equations,srh_node.equation_no,i)
                              routes.append(sub_node)
                              cur_routes_ptr += 1
      #搜索队列/上次搜索指针更新
      last_routes_ptr = cur_routes_ptr_tmp
    #debug test:打印所有从起点开始发展出来的两个节点之间连线
    print("#################所有从起点开始发展出来的两个节点之间连线")
    for r in range(0,len(routes)):
      srh_node = routes
      no = srh_node.equation_no
      print("<%d:%s>来自于方程式编号:<%d:%s>" % (no,chem_list.get_equation(),srh_node.equafrom,chem_list.get_equation()))
    #打印所有构成环路的线路
    print("#################所有构成环路的线路")
    for c in range(0,len(circles)):
      print(circles)
main()

结果(只是以方程式0为起始点的一个列子,如果需要找出其他环路,那么再加一个外层循环:起始点就要遍历所有方程,
另外搜索中为了避免打转,标记了已访问节点,那么有些环路被忽视了:比如0->1->3,和0->1->2->3,因为第二条线路到3节点晚了,所有被忽视了):
#################方程式列表
<0>a+b=c+d
<1>c=e+f
<2>f+g=a+h
<3>c+g=d+h
<4>d=m+n
<5>m+g=b+x
<6>s+t=u+v
#################元素在左侧的方程式:元素,方程式列表
a
b
c
f
g
d
m
s
t
#################所有从起点开始发展出来的两个节点之间连线
<0:a+b=c+d>来自于方程式编号:<0:a+b=c+d>
<1:c=e+f>来自于方程式编号:<0:a+b=c+d>
<3:c+g=d+h>来自于方程式编号:<0:a+b=c+d>
<4:d=m+n>来自于方程式编号:<0:a+b=c+d>
<2:f+g=a+h>来自于方程式编号:<1:c=e+f>
<5:m+g=b+x>来自于方程式编号:<4:d=m+n>
#################所有构成环路的线路
方程式0->方程式1->方程式2->方程式0
方程式0->方程式4->方程式5->方程式0

_2_ 发表于 2020-5-30 12:48:00

糖逗 发表于 2020-5-29 22:45
感觉这是个递归问题可能还涉及到图(数据结构中有关于找图中环的问题)

还没学到化学,
无缘了{:10_269:}

_荟桐_ 发表于 2020-5-30 12:51:43

_2_ 发表于 2020-5-30 12:48
还没学到化学,
无缘了

应该和化学没多大关系吧
和这道题有一丢丢像
https://fishc.com.cn/thread-170547-1-5.html

_2_ 发表于 2020-5-30 12:52:35

_荟桐_ 发表于 2020-5-30 12:51
应该和化学没多大关系吧
和这道题有一丢丢像
https://fishc.com.cn/thread-170547-1-5.html

不懂写出来就不一样
自己也不理解{:10_266:}

java2python 发表于 2020-5-31 12:03:15

搜索一下:带权重无向图 最短路径

13691255250 发表于 2020-5-31 13:18:33

java2python 发表于 2020-5-30 12:16
结果(只是以方程式0为起始点的一个列子,如果需要找出其他环路,那么再加一个外层循环:起始点就要遍历 ...

大神,你好,我刚看到你回的帖子,太完美了!
方便加个微信吗?我好像是账号等级不够,没法私聊
请问怎么再外层加个循环,让七点遍历所有方程呀

java2python 发表于 2020-5-31 13:38:09

13691255250 发表于 2020-5-31 13:18
大神,你好,我刚看到你回的帖子,太完美了!
方便加个微信吗?我好像是账号等级不够,没法私聊
请问怎 ...

过奖,其实和外面博客程序比,差不少。
外层加循环:
第53行def main()
改为:def srh(srhno):
第118行main()
改为:
srh(0)
srh(1)
第69行:    srh_node = Srh_node(0,0,0)
    srh_node = Srh_node(srhno,0,0)
就行了,另外输出:方程式0->方程式2->方程式0->方程式0的地方,我把开头和结尾都固定了,这里也要改
如果在一个环路中,可能输出相同(只是开头节点变化),如果在不同环路中(不相连),原先是连不上,输出不了结果,现在因为有了切入点,可以输出了。

13691255250 发表于 2020-6-2 14:47:01

java2python 发表于 2020-5-30 12:16
结果(只是以方程式0为起始点的一个列子,如果需要找出其他环路,那么再加一个外层循环:起始点就要遍历 ...

大神,能帮我理解下第81行吗?我感觉srh_node是类Srh_node的一个实例,routes是刚创建的空列表,routes【i】是这个列表的第i个元素, 那srh_node = routes怎么理解呀?

java2python 发表于 2020-6-2 15:10:34

本帖最后由 java2python 于 2020-6-2 18:17 编辑

13691255250 发表于 2020-6-2 14:47
大神,能帮我理解下第81行吗?我感觉srh_node是类Srh_node的一个实例,routes是刚创建的空列表,routes ...

Srh_node是一个数据类,存放:(#方程式编号,#本节点来自于方程式编号,#本节点来自于搜索队列号)
方程式编号:就是chem_list里的第几个方程,A+B=C+D,这是第0个方程式,那么方程式编号就是0

本节点来自于方程式编号:比如从A+B=C+D,找到C,那么C作为反应物的方程式,比如C=e+f,建立C的搜索节点时,他的方程式编号是1,那么搜索的时候他是怎么来的,比如完全独立的(x+y=z),他不可能通过A+B=C+D出发的来找到,来自于方程式,表示这个C是哪个方程式产生的意思,换句话说,方程式编号就是C是反应物的方程式,来自于方程式,就是C是生成物的方程式编号,希望说了一堆别更糊涂。

本节点来自于搜索队列号:比如是通过第0个搜索节点来的,那么来自于搜索节点号就是0,一开始都是0,实际搜索展开后,这些数字是不同的。

程序写的不太好,比如列表中,有某个类,但你找不到,甚至是词典a->b,可以用key来搜索,但反过来知道b,a也是找不到,当然可以用循环来找,这样程序全乱了。
你首先是简化数据,让程序循环数最少,比如就只有三个产生式,就像你所举的例子,再加一个无关的,比如x+y=z,这和查找的不构成环路。然后调试,看看能不能理解,其实这程序能改进的地方太多了

已经费了很多力气了,不再回复了。。。
程序结构变动,Srh_node改为SRH类,里面具体成员就两个(方程号,方程来自于搜索节点),静态成员chem_list_visted已访问方程式,circles存放找到的环路:
#反应方程式
classChem:
    chem_list = []
    react_map = {} #某元素是反应物的词典:(0)a+b=c+d (7)a+m=k+l 那么map中就有一条{'a':}
    def __init__(self,left,right):
      self.left = left
      self.right = right
      Chem.chem_list.append(self)
    #打印方程式:a+b=c+d
    def get_equation(self):
      chem_equ = ""
      for l in range(0,len(self.left)):
            chem_equ = chem_equ + self.left + "+"
      chem_equ = chem_equ + "="
      for r in range(0,len(self.right)):
            chem_equ = chem_equ + self.right + "+"
      chem_equ = chem_equ
      return chem_equ

    @staticmethod
    def ele_in_equation_left():
      for c in range(0,len(Chem.chem_list)):
            chem = Chem.chem_list
            left = chem.left
            for l in range(0,len(left)):
                element = Chem.react_map.get(left)
                if element == None:
                  Chem.react_map.update({left:})
                else:
                  element.append(c)

#搜索节点:
class SRH:
    chem_list_visted = {}    #已访问节点
    circles = []      #构成环路路线:保存字符串:方程式0->方程式4->方程式5->方程式0
    start = 0         #搜索起点
    def __init__(self,equation_no,routefrom):
      self.equation_no = equation_no       #方程式编号
      self.routefrom = routefrom         #本节点来自于搜索队列号
      SRH.chem_list_visted.update({self.equation_no:self})
    #搜索环路
    @staticmethod
    def srh(srhno):
      SRH.start = srhno
      srh_node = SRH(SRH.start,None)
      #上次搜索到节点,本次搜索到节点
      step0_nodes =
      step1_nodes = []
      #第一次从初节点开始,不断发展,直到发展不出新节点
      while len(step0_nodes) > 0:
            for n in range(0,len(step0_nodes)):
                #从队列取出一个节点(方程式),把这个方程式中的生成物,作为反应物的方程式全部找出,加入step1_nodes
                srh_node = SRH.chem_list_visted.get(step0_nodes)
                SRH.add_next_step_nodes(srh_node,step1_nodes)
            #用这次搜索到的节点(step1_nodes),复制给step0_nodes,作为下一次搜索的初始化
            step0_nodes = step1_nodes[:]
            step1_nodes.clear()
      #打印所有构成环路的线路
      print("#################方程式<%d>为起点的所有环路" % SRH.start)
      for c in range(0,len(SRH.circles)):
            print(SRH.circles)
      SRH.chem_list_visted.clear()
      SRH.circles.clear()

    @staticmethod
    def get_visited(ikey):
      return SRH.chem_list_visted.get(ikey)
    @staticmethod
    def is_visited(ikey):
      return SRH.chem_list_visted.get(ikey) != None
    @staticmethod
    def add_next_step_nodes(srh_node,step1_nodes):
      #该方程式取出生成物
      right = Chem.chem_list.right
      for r in range(0,len(right)):
            #对所有生成物查找他们作为反应物的方程式
            equations = Chem.react_map.get(right)
            if equations == None:
                continue
            #把这些方程式中没有访问过的,全部加入队列
            for e in range(0,len(equations)):
                if SRH.start == equations:
                  SRH.find_circle(srh_node)
                elif SRH.is_visited(equations) == False:
                  SRH(equations,srh_node)
                  step1_nodes.append(equations)

    @staticmethod
    def find_circle(node):
      #回到初始节点
      circle_node = node
      route_str = "->方程式" + str(circle_node.equation_no) + "->方程式"+str(SRH.start)
      while circle_node.routefrom.equation_no != SRH.start:
            circle_node = circle_node.routefrom
            route_str = "->方程式" + str(circle_node.equation_no) + route_str
      route_str = "方程式"+str(SRH.start) + route_str
      SRH.circles.append(route_str)

#初始化反应方程式列表
def init_equation_list():
    Chem(['a','b'],['c','d'])
    Chem(['c'],['e','f'])
    Chem( ['f','g'],['a','h'])
    Chem(['c','g'],['d','h'])
    Chem(['d'],['m','n'])
    Chem(['m','g'],['b','x'])
    Chem(['s','t'],['u','v'])

init_equation_list()
Chem.ele_in_equation_left()
#debug :打印方程式列表
print("#########################DEBUG 显示方程组初始化结果是否正确")
print("-----------------方程式列表")
for i in range(0,len(Chem.chem_list)):
    print("<%d>%s" % (i,Chem.chem_list.get_equation()))
#debug test:打印元素在左侧的方程式:元素,方程式列表
print("-----------------元素在左侧的方程式:元素,方程式列表")
for item in Chem.react_map.items():
    print(item,item)
for e in range(len(Chem.chem_list)):
    SRH.srh(e)
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