flye求指导
有无大佬知道怎么用flye 1、安装Flye模块:可以使用pip安装Flye模块,命令如下:pip install flye
2、导入Flye模块:在Python脚本中导入Flye模块:
import flye
3、运行Flye组装:使用以下代码来运行Flye组装:
assembly = flye.assemble("input_reads.fastq", out_dir="output_directory")
其中,input_reads.fastq是输入的FASTQ格式长读长数据文件名,output_directory是Flye将输出文件放置的目录。运行完成后,Flye将返回组装后的序列。
4、解析结果:完成后,你可以使用基因组分析工具来评估组装结果的质量,并进一步分析你的数据。
Flye的Python模块可以使用更多的选项和参数来优化组装结果。你可以查看Flye的文档以了解更多信息。 isdkz 发表于 2023-3-20 18:32
1、安装Flye模块:可以使用pip安装Flye模块,命令如下:
这语气{:10_334:} 歌者文明清理员 发表于 2023-3-20 18:51
这语气
没毛病 isdkz 发表于 2023-3-20 18:52
没毛病
好吧可能是误会
因为编程学的深入一点就会这样
我昨天去了图书馆(看 python),看到有一位大佬全片用的这种语气
确实我发现自己有时候也会用
应该是误会,对不起 isdkz 发表于 2023-3-20 18:32
1、安装Flye模块:可以使用pip安装Flye模块,命令如下:
感谢大佬,这个pip换成conda怎么样,我看好多都是conda安装的 pythonstudy2023 发表于 2023-3-21 09:07
感谢大佬,这个pip换成conda怎么样,我看好多都是conda安装的
换成 conda 也可以 isdkz 发表于 2023-3-21 10:02
换成 conda 也可以
大佬,PackagesNotFoundError: The following packages are not available from current channels:,这种情况咋办,装不上好像 pythonstudy2023 发表于 2023-3-21 10:39
大佬,PackagesNotFoundError: The following packages are not available from current channels:,这种 ...
我搜了一下,好像搜不到这个库,你确定 python 有 flye 这个库吗? pythonstudy2023 发表于 2023-3-21 10:39
大佬,PackagesNotFoundError: The following packages are not available from current channels:,这种 ...
不知道是不是被下架了,你换一种方式安装把:
https://blog.csdn.net/qq_50637636/article/details/122223105
isdkz 发表于 2023-3-21 11:27
不知道是不是被下架了,你换一种方式安装把:
https://blog.csdn.net/qq_50637636/article/details/12 ...
好的,我试试 isdkz 发表于 2023-3-21 11:27
不知道是不是被下架了,你换一种方式安装把:
https://blog.csdn.net/qq_50637636/article/details/12 ...
我用git装,make指令出问题了,这个是不是得用linux系统 {:5_106:}
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