[已解决]flye求指导

pythonstudy2023

有无大佬知道怎么用flye

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isdkz

2023-3-20 18:32:14

1、安装Flye模块：可以使用pip安装Flye模块，命令如下：

pip install flye

2、导入Flye模块：在Python脚本中导入Flye模块：

import flye

3、运行Flye组装：使用以下代码来运行Flye组装：

assembly = flye.assemble("input_reads.fastq", out_dir="output_directory")

其中，input_reads.fastq是输入的FASTQ格式长读长数据文件名，output_directory是Flye将输出文件放置的目录。运行完成后，Flye将返回组装后的序列。

4、解析结果：完成后，你可以使用基因组分析工具来评估组装结果的质量，并进一步分析你的数据。

Flye的Python模块可以使用更多的选项和参数来优化组装结果。你可以查看Flye的文档以了解更多信息。

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isdkz

1、安装Flye模块：可以使用pip安装Flye模块，命令如下：

pip install flye

2、导入Flye模块：在Python脚本中导入Flye模块：

import flye

3、运行Flye组装：使用以下代码来运行Flye组装：

assembly = flye.assemble("input_reads.fastq", out_dir="output_directory")

其中，input_reads.fastq是输入的FASTQ格式长读长数据文件名，output_directory是Flye将输出文件放置的目录。运行完成后，Flye将返回组装后的序列。

4、解析结果：完成后，你可以使用基因组分析工具来评估组装结果的质量，并进一步分析你的数据。

Flye的Python模块可以使用更多的选项和参数来优化组装结果。你可以查看Flye的文档以了解更多信息。

歌者文明清理员

isdkz 发表于 2023-3-20 18:32
1、安装Flye模块：可以使用pip安装Flye模块，命令如下：

这语气

isdkz

歌者文明清理员 发表于 2023-3-20 18:51
这语气

没毛病

歌者文明清理员

isdkz 发表于 2023-3-20 18:52
没毛病

好吧可能是误会
因为编程学的深入一点就会这样
我昨天去了图书馆（看 python），看到有一位大佬全片用的这种语气
确实我发现自己有时候也会用
应该是误会，对不起

pythonstudy2023

isdkz 发表于 2023-3-20 18:32
1、安装Flye模块：可以使用pip安装Flye模块，命令如下：

感谢大佬，这个pip换成conda怎么样，我看好多都是conda安装的

isdkz

pythonstudy2023 发表于 2023-3-21 09:07
感谢大佬，这个pip换成conda怎么样，我看好多都是conda安装的

换成 conda 也可以

pythonstudy2023

isdkz 发表于 2023-3-21 10:02
换成 conda 也可以

大佬，PackagesNotFoundError: The following packages are not available from current channels:，这种情况咋办，装不上好像

isdkz

pythonstudy2023 发表于 2023-3-21 10:39
大佬，PackagesNotFoundError: The following packages are not available from current channels:，这种 ...

我搜了一下，好像搜不到这个库，你确定 python 有 flye 这个库吗？

isdkz

pythonstudy2023 发表于 2023-3-21 10:39
大佬，PackagesNotFoundError: The following packages are not available from current channels:，这种 ...

不知道是不是被下架了，你换一种方式安装把：

https://blog.csdn.net/qq_50637636/article/details/122223105

pythonstudy2023

isdkz 发表于 2023-3-21 11:27
不知道是不是被下架了，你换一种方式安装把：

https://blog.csdn.net/qq_50637636/article/details/12 ...

好的，我试试

pythonstudy2023

isdkz 发表于 2023-3-21 11:27
不知道是不是被下架了，你换一种方式安装把：

https://blog.csdn.net/qq_50637636/article/details/12 ...

我用git装，make指令出问题了，这个是不是得用linux系统

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