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哪位大神帮忙解决几个python的小问题,感激不尽啊

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发表于 2016-1-3 20:24:57 | 显示全部楼层 |阅读模式

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>LOC_Os01g01010.1 gene=LOC_Os01g01010
TCATTCCGAGCCCCCCTTCAATAACTTGTAAATATACTTCTTCCTCAGCTTGATAGCCATGCGTACGCATCTTTTTACATTGATCTTCAGCATATTATCATTGAACATCTTGATTGCATCATCTATTGAGCGAGTTTCTCTAATTATCTTGTGGCGATTGATTACAAGGATTGCTGCTACGCAGAATATAGGCAGATCATCATCTCCATTCTTTGCTAACACATTTGTGCTTATATGTGGCATCTGCTGATGTCTTGCCCAAATAGTAGCTCCTGACAAGCCACAGAGGGGATTTCTTGTATTGGGTTTCATTCCAAGGTTGCAAGCTACACGCATTTCACCATTTCTATGATGGGGCTTCCTGCTTTTGGACTTTCTTCTTGTGTAACTGTTCACCCGGTGCTCTTCTTTCACCTCACATGATAAATCATTCCTCATATCTACCAGCAATGGCTCCAGACAATTCTCTTCCAAATGTAAAATCACATCTTCATTAAAGTCAGCAGCCCACATCATCTCCCACATGCTAAGTGACTCCTCAAAGGACAGCTCTCGACGAAAAAGCACTAGCAGCATCCGGAAAGCAAAATGAAGGCTTTCAGCACCAATTGTTGACAAATGTTCAAATAATTCTACATCAGTTATTTCCATGATCTTCCACAATGCTTGCAACTGCTTCATAACTCCTGTTGGTCCCTCCATCTGGAAATTTTCACGCATCCTTCTCAGTAGCATCTCAAAGCACCAAAAGGCATCTGCATCATCCTCATAGAGAACAACAAAAGGTGAAAGTAGATCACTCATACCTTGGCAATACCCGGTGGAAGGATCAACCCATGCATAAACTGCAAGTATATCTGACATCCTAGCCATATTTCTTGATTCTCCATAGAAATCAAGATGACTATCCGTTCTAACCACATCAACCACAATTCGGTGCAGTGTCCAAAGCCATTCAGAGACTCGATCTTTGCTGGCAACCACACTGTTGGATTTGGTTCCATCAACAAAATCTGCTTCTGGTGCATCAGATATCCTCAAGGAATCTATAACTTCCCTGTTATAGCCATTATCATCTAACCATCTATCCTGCTTGTATGCATCTGAGTGAAAGATGGCTGAATCACTGTTGCTAGCCCTAAACACATCACTGGAGCATGAATTTGACTCTATAATGAGATCTATGTTATTATTGATTTGGAAGCTGTGCATACGTTCATCACGGTGCCTTAATCTATCTTCAGGAACTGAGAAACTACAATGATTTTTATCAACTCCATTGCTGCCCACACCATCAGTTGAGAAAAAATTTGTAACAGGTAGAGAAGGATAATCATCGAAGGTCTCAGTGTCATATCTTGGTTCACCCATGTCATTGTAATCCTGAGAATCTTTTGAGCAATTATTCACTTCTGTAGAAGACACAATAAAATTGGAAGAATCATAAAGAGAGGTATCATTATGTACGTTGAAACCAACTAGTTCAGCTGATTTACTACAGCTTTCCCTTTTTTGTGACTGCTGTGCACCACCGGGGCCATAATCTGAATCTTCTACTAAACTGCCAGCTGTATTTTGTGAAGTTTGTTGACTTGTGCTAACTTCTTCTGCAATGTGGGTTTCTTTTGACATAGTCCTGACATCCATTAGCTTTGATCCAACAGCGTAAGCAAGCTCACCTGTACCAATGCTTGGGTGCATGCTCTGGCACTGTCTAACTAAAATTTGATATTTTTCCCTTCTAACAGCTCTTAGTTTCCTCCTATACTCTGAGGTACTACTCAAGGCATAGCAGCCAAGAAGAAATTCCCAAACTTCAGCTCGAATAGTGGGATCCACACCCCCTAAGACAATGAATTTTAGGGCTTTACGGAAACCTATGACCTTTCCATCATTATCAAAACATGTGTGCCATTTTTCCGGTTTGAGCATTTTGCTCCCCTTAACGGGGGATGGGTTGAGGCAGGGGTCGCCAATGTCACGGACGAGGGAGCCAACGCCGCGCTGGAGGTTGGCCATGGCGCCGCCCGCACGGCCACCGGCGCCGCACATCCACTTGATGTAGTCCCCAGCGGTATCTCCGTTGTCTTGGCCCGCGGCCGACGACAT

1. 以上序列是水稻的一条cds序列(反向),请屏幕输入到程序中,获得其反向互补序列,打印到屏幕
2. 根据其反向互补序列,翻译出该序列对应的蛋白质序列,并输出到屏幕
密码子对应表为:
   
        'AAA' => 'K',        'AAC' => 'N',        'AAG' => 'K',        'AAT' => 'N',
        'ACA' => 'T',        'ACC' => 'T',        'ACG' => 'T',        'ACT' => 'T',       
        'AGA' => 'R',        'AGC' => 'S',        'AGG' => 'R',        'AGT' => 'S',       
        'ATA' => 'I',        'ATC' => 'I',        'ATG' => 'M',        'ATT' => 'I',       
        'CAA' => 'Q',        'CAC' => 'H',        'CAG' => 'Q',        'CAT' => 'H',       
        'CCA' => 'P',        'CCC' => 'P',        'CCG' => 'P',        'CCT' => 'P',       
        'CGA' => 'R',        'CGC' => 'R',        'CGG' => 'R',        'CGT' => 'R',
        'CTA' => 'L',        'CTC' => 'L',        'CTG' => 'L',        'CTT' => 'L',       
        'GAA' => 'E',        'GAC' => 'D',        'GAG' => 'E',        'GAT' => 'D',       
        'GCA' => 'A',        'GCC' => 'A',        'GCG' => 'A',        'GCT' => 'A',
        'GGA' => 'G',        'GGC' => 'G',        'GGG' => 'G',        'GGT' => 'G',       
        'GTA' => 'V',        'GTC' => 'V',        'GTG' => 'V',        'GTT' => 'V',       
        'TAA' => '*',        'TAC' => 'Y',        'TAG' => '*',        'TAT' => 'Y',       
        'TCA' => 'S',        'TCC' => 'S',        'TCG' => 'S',        'TCT' => 'S',       
        'TGA' => '*',        'TGC' => 'C',        'TGG' => 'W',        'TGT' => 'C',       
        'TTA' => 'L',        'TTC' => 'F',        'TTG' => 'L',        'TTT' => 'F'

3. 计算该序列中CG含量最高的25bp区域。提示:将该序列,以25bp为window,1bp为step 循环计算,取最大CG含量值对应的区域,打印到屏幕。
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