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[已解决]红色代码运行完,并未向txt文件中写入结果,求大神指点

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发表于 2020-5-20 22:46:27 | 显示全部楼层 |阅读模式

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代码运行未提示错误,但红色代码运行完,并未向txt文件中写入结果,不知为何,求大神指点!
fo=open('sequence.txt','r')
fi=open('result.txt','w')
seq=''
ls=[]
for line in fo:
    if line[0]=='>' and seq=='':
        header=line
    elif line[0]!='>':
        seq+=line.strip()
    else:
        ls.append([header,seq,len(seq)])
        seq=''
        header = line
ls.append([header,seq,len(seq)])
ls=sorted(ls,key=lambda x:x[2])
print(ls)
for item in ls:
    fi.write(item[0])
    for i in range(len(item[1])//60):
        fi.write(item[1][60*(i+1)-60:60*(i+1)]+'\n')
        fi.write(item[1][60*(i+1):]+'\n')

fi.close()
fo.close()
最佳答案
2020-5-20 23:16:16
虽然没大明白你的需求,但可以看出你算法有问题, for i in range(len(item[1])//60),其中len(item[1])都小于60,地板除60后等于0,这个循环进不去,里面的内容不会被执行。
想知道小甲鱼最近在做啥?请访问 -> ilovefishc.com
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 楼主| 发表于 2020-5-20 22:52:14 | 显示全部楼层
sequence.txt内容如下:
>lcl|HQ338291.1_gene_1 [gene=psbJ] [location=<1..47] [gbkey=Gene]
MAAAAAAAAAAAAAAA
TTTTAAAAAAAAAAAAA

>lcl|HQ338286.1_gene_1 [gene=psbJ] [location=<1..47] [gbkey=Gene]
AGGTTT
CCCCCC

>lcl|HQ338272.1_gene_1 [gene=psbJ] [location=<1..47] [gbkey=Gene]
MAAAAGCCC
CCCCCCCCCC

>lcl|HQ338264.1_gene_1 [gene=psbJ] [location=<1..47] [gbkey=Gene]
MGGGGAAAAAA
CCCCCCCCCCCC
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 楼主| 发表于 2020-5-20 23:05:10 | 显示全部楼层
只知道如果,MAAAAAAAAAAAAAAATTTTAAAAAAAAAAAAA这样的字母数不超过60,就无法写入,问题应该是出在range函数与地板除上,但不知道原理
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发表于 2020-5-20 23:16:16 | 显示全部楼层    本楼为最佳答案   
虽然没大明白你的需求,但可以看出你算法有问题, for i in range(len(item[1])//60),其中len(item[1])都小于60,地板除60后等于0,这个循环进不去,里面的内容不会被执行。
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 楼主| 发表于 2020-5-20 23:19:09 | 显示全部楼层
哦 算错了
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