怎样写.fst 文件中小于0的数替换为0代码啊？

不熟lan · 发表于 2021-3-27 20:38:44

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求大神们帮忙：怎样写.fst 文件中小于0的数替换为0的python代码啊？

suchocolate · 发表于 2021-3-27 20:53:21

fst是文本文件吗？

不熟lan · 发表于 2021-3-29 22:15:30

suchocolate 发表于 2021-3-27 20:53
fst是文本文件吗？

是的

suchocolate · 发表于 2021-3-30 13:05:13

不熟lan 发表于 2021-3-29 22:15
是的

贴出fst文件的内容

不熟lan · 发表于 2021-3-30 22:13:42

suchocolate 发表于 2021-3-30 13:05
贴出fst文件的内容

ROM                      BIN_START  BIN_END  N_VARIANTS  WEIGHTED_FST  MEAN_FST
Contig00024                67501    68500 1          0          0
Contig00024                68001    69000 1          0          0
Contig00125                69501    70500 1          0.5          0.5
Contig00125                70001    71000 1          0.5          0.5
Contig02708_ERROPOS1173400 88501    89500 1          0          0
Contig02708_ERROPOS1173400 89001    90000 1          0          0
Contig03223                27501    28500 1          0          0
Contig03223                28001    29000 1          0          0

suchocolate · 发表于 2021-3-30 22:24:33

本帖最后由 suchocolate 于 2021-3-30 22:49 编辑

不熟lan 发表于 2021-3-30 22:13
ROM BIN_START BIN_END N_VARIANTS WEIGHTED_FST MEAN_FST
Contig00024 ...

你这个文档没有小于0的数啊？
简单写了一个，其中2处数据我写了负数：
Screenshot 2021-03-30 224134.jpg

with open('data.txt') as f:
    data = f.readlines()

with open('output.txt', 'w') as f:
    for line in data:
        txt = line.split()
        for n, v in enumerate(txt):
            if v.startswith('-'):
                txt[n] = '0'
        f.write(' '.join(txt) + '\n')

实际处理数据还是用numpy或pandas更合适，以文本形式效率太低。

不熟lan · 发表于 2021-3-31 10:52:03

好的，我知道啦，非常感谢您的帮助

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