python 问题求助

代码小白liu

本身是别的小伙伴问的问题，由于本人学艺不精，解题一半就卡住了：
需要提取一行ID 一行序列号，以ID为名简历文件夹，相同ID的序列号均存放在一个ID文件里

1. import re
   
2. text = '''
   
3. >FA-Oe9L01-01
   
4. TCGTTTTGGTATTTTCTCTTTTGTCTTTTA
   
5. >FA-Oe9L01-01
   
6. TCGTTTTGGTATTTTCTCTTTTGTCTTTAA
   
7. >FA-Oe9L01-01
   
8. TCGTTTTGGTATTTTCTCTTTTGTCTTTTA
   
9. >FA-Oe9L01-03
   
10. GATGTGCACATAGAGATGTCTTACTGCACC
    
11. >FA-Oe9L01-03
    
12. GATGTGCACATAGAGATGTCTTACTGCAGC
    
13. >FA-Oe9L01-03
    
14. GATGTGCACATAGAGATGTCTTACTGCACC
    
15. >FA-Oe9L01-03
    
16. GATGTGCACATAGAGATGTCTTACTGCACA
    
17. '''
    
18. 
    
19. Id = re.compile("[A-Za-z]+-[A-Za-z0-9]+-\d+") #匹配ID
    
20. 
    
21. Xulie = re.compile("[A-Za-z]{30}") #匹配序列号
    
22. 
    
23. Id_list = re.findall(Id, text)
    
24. # print(Id_list)
    
25. Xulie_list = re.findall(Xulie, text)
    
26. for i in Id_list:
    
27.     with open(i, "w+") as f:
    
28.         for j in Xulie_list:
    
29. 
    
30.             f.write(j)
    
31. 
    
32. 
    

复制代码

ID和序列号我都正则匹配出来了，在保存的时候我遇到了问题
本来想的是一个ID建一个文件夹，然后对应序列号存进去，ID文件夹已经存在时，就直接把序列号写入
我这么写肯定是不对，文件名能出来，但是内容会写进全部的序列号，这个希望大佬指导下


或者说用字典形式吗？一个ID对应多个值，存入字典，然后用字典的键和值分别对应文件名和内容是不是好点，但是一个ID对应多个值这个字典不大知道改如何写出来

kogawananari

看不懂但是内容会写进全部的序列号这句话是什么意思  不过正则肯定可以优化 毕竟字母只有AGCTU

kogawananari

1. from pathlib import Path
   
2. cwd = Path.cwd()
   
3. thiskey = '无id'
   
4. opt_dir = cwd / Path('opt')
   
5. opt_dir.mkdir(parents=True, exist_ok=True)
   
6. with open(cwd / Path('fasta.txt')) as f:
   
7.     for line in f.readlines():
   
8.         if line[0] == '>':
   
9.             thiskey = line[1:-1]
   
10.         else:
    
11.             with open(opt_dir.joinpath(thiskey+'.txt'),'a') as id:
    
12.                 id.write(line)
    

复制代码

代码小白liu

kogawananari 发表于 2021-8-20 22:39

这块知识还没学过，尴尬  研究一下，感谢回答

代码小白liu

kogawananari 发表于 2021-8-20 22:15
看不懂但是内容会写进全部的序列号这句话是什么意思  不过正则肯定可以优化 毕竟字母只有AGCTU

就是会新建两个文件，但是每个文件的内容是全部序列号

kogawananari

代码小白liu 发表于 2021-8-21 08:34
就是会新建两个文件，但是每个文件的内容是全部序列号

这不就是需求吗

赖宝宝

给我的感觉，你的需求很简单，能轻松实现，但是你没表述明白，我给不出一个具体的代码

代码小白liu

赖宝宝 发表于 2021-8-22 23:16
给我的感觉，你的需求很简单，能轻松实现，但是你没表述明白，我给不出一个具体的代码

第一行是ID  第二是ID对应的序列号，新建文件，以ID为文件名，序列为内容，相同ID的序列号存入到一个文件夹