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[已解决]序列生成

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发表于 2023-9-8 17:24:52 | 显示全部楼层 |阅读模式

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现在我想生成一个长度为6的序列,每一位从A,T,C,G中取,实际上就是得到长度为6个碱基的所有DNA序列,求助一下大佬们
最佳答案
2023-9-8 17:25:07
你可以使用递归来生成长度为6的所有DNA序列。下面是一个示例的Python代码:
def generate_sequences(length, bases, sequence):
    if length == 0:
        print(sequence)
        return
    for base in bases:
        generate_sequences(length - 1, bases, sequence + base)

bases = ['A', 'T', 'C', 'G']
generate_sequences(6, bases, '')

这段代码定义了一个递归函数 generate_sequences ,它接受三个参数: length 表示序列的长度, bases 表示碱基的选项, sequence 表示当前生成的序列。当 length 为0时,递归结束,打印出生成的序列。否则,对于每个碱基选项,递归调用 generate_sequences ,将长度减1,并将当前的碱基添加到序列中。

通过调用 generate_sequences(6, bases, '') ,你可以生成所有长度为6的DNA序列。
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发表于 2023-9-8 17:25:05 | 显示全部楼层
生成DNA序列的长度为6的所有可能组合

要生成长度为6的所有可能的DNA序列,可以使用递归方法。以下是修改后的代码:
def generate_dna_sequences(length, sequence=''):    bases = ['A', 'T', 'C', 'G']        if length == 0:        print(sequence)    else:        for base in bases:            new_sequence = sequence + base            generate_dna_sequences(length - 1, new_sequence)generate_dna_sequences(6)
在上述代码中,我们定义了一个递归函数 generate_dna_sequences,它接受两个参数:length 表示要生成的序列长度,sequence 表示当前正在生成的序列。

在每次递归调用中,我们循环遍历碱基(A、T、C、G),将当前的碱基追加到 sequence 中,并将长度减一。当长度为零时,我们打印出生成的完整序列。

通过不断递归调用函数,我们可以生成所有长度为6的DNA序列。注意,这个方法会生成所有可能的组合,因此可能会有大量的输出。

希望以上代码能够满足您的需求。如果还有其他问题,请随时提问。

球一个最佳答案谢谢啦!这对我非常重要!
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发表于 2023-9-8 17:25:07 | 显示全部楼层    本楼为最佳答案   
你可以使用递归来生成长度为6的所有DNA序列。下面是一个示例的Python代码:
def generate_sequences(length, bases, sequence):
    if length == 0:
        print(sequence)
        return
    for base in bases:
        generate_sequences(length - 1, bases, sequence + base)

bases = ['A', 'T', 'C', 'G']
generate_sequences(6, bases, '')

这段代码定义了一个递归函数 generate_sequences ,它接受三个参数: length 表示序列的长度, bases 表示碱基的选项, sequence 表示当前生成的序列。当 length 为0时,递归结束,打印出生成的序列。否则,对于每个碱基选项,递归调用 generate_sequences ,将长度减1,并将当前的碱基添加到序列中。

通过调用 generate_sequences(6, bases, '') ,你可以生成所有长度为6的DNA序列。
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 楼主| 发表于 2023-9-8 17:40:09 | 显示全部楼层
isdkz 发表于 2023-9-8 17:25
你可以使用递归来生成长度为6的所有DNA序列。下面是一个示例的Python代码:

这个所得序列写进文本文件要怎么写比较好呢
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