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发表于 2021-2-15 09:08:49 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本帖最后由 leoric666 于 2021-2-15 09:45 编辑

代码1
seq = 'GCCGGCCCTCAGACAGGAGTGGTCCTGGATGTGGATG'
kmer_length = 6
kmer_dictionary = {}
stop = len(seq) - kmer_length + 1
for start in range(0, stop):
    kmer = seq[start:start + kmer_length]
    if kmer in kmer_dictionary:
        kmer_dictionary[kmer] += 1
    else:
        kmer_dictionary[kmer] = 1
t = "\t"
for kmer in kmer_dictionary:
    count = kmer_dictionary[kmer]
    out = (kmer, str(count))
    print(t.join(out))

代码2
aip_kmers = open("newlines.txt",'w')
kmer1 = "ATGCNA"
kmer2 = "AAGCNC"
# Append newline when using write
aip_kmers.write(kmer1 + "\n")
aip_kmers.write(kmer2 + "\n")
# Appending newline not needed when using print
print(kmer1)
aip_kmers.close()

请问大家我如何把代码一中的基因序列全部保存到想代码2那样的文件中
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发表于 2021-2-15 10:24:14 | 显示全部楼层

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