AP聚类算法是一种无监督学习算法,用于将数据集划分成不相交的簇。相似度计算通常使用欧氏距离。
AP聚类算法主要包括以下几个步骤:
1. 初始化:选择一个合适的相似度矩阵(欧氏距离矩阵),设置阻尼系数damping、最大迭代次数max_iter和收敛阈值tol。
2. 计算吸引度(responsibility)和归属度(availability):
a. 根据相似度矩阵初始化吸引度矩阵R和归属度矩阵A。
b. 迭代更新吸引度和归属度直到收敛:
i. 更新吸引度矩阵R:对于每个数据点,计算与其他数据点的相似度加上归属度的最大值,并减去与其他数据点的相似度加上归属度的次大值。
ii. 更新归属度矩阵A:对于每个数据点,计算所有其它数据点希望归属于该点的吸引度之和,然后减去希望归属于其他点并且希望该点归属于该点的吸引度之和。如果结果为负,则设置为0。
3. 划分簇:通过归属度矩阵A确定每个数据点的最终簇归属。
下面是用Python实现AP聚类算法的示例代码:
import numpy as np
def euclidean_distance(x, y):
return np.sqrt(np.sum((x - y) ** 2))
def affinity_propagation(data, damping, max_iter, tol):
n = len(data)
similarities = -np.array([[euclidean_distance(data[i], data[j]) for j in range(n)] for i in range(n)])
R = np.zeros_like(similarities)
A = np.zeros_like(similarities)
converged = False
iteration = 0
while not converged and iteration < max_iter:
old_R = np.copy(R)
old_A = np.copy(A)
# 更新吸引度矩阵R
A += similarities
max_A = np.max(A, axis=1)
idx = np.arange(n)
A[idx, idx] = max_A
A -= max_A.reshape((-1, 1))
A *= (1 - damping)
A = np.minimum(A, 0)
# 更新归属度矩阵A
Rp = np.maximum(0, R)
Rp[idx, idx] = R[idx, idx]
total = np.sum(Rp, axis=0)
mask = total > 0
A[:, mask] -= Rp[:, mask]
diag = np.diag(A).copy()
A = np.minimum(A, 0)
A[idx, idx] = diag
# 判断是否收敛
converged = np.allclose(old_R, R, atol=tol) and np.allclose(old_A, A, atol=tol)
iteration += 1
# 划分簇
clusters = np.where(A + R > 0)[1]
return clusters
# 使用示例
data = np.array([[1, 2], [3, 4], [5, 6], [7, 8]])
clusters = affinity_propagation(data, damping=0.5, max_iter=100, tol=1e-6)
print(clusters)
希望这个示例代码能帮助到你理解AP聚类算法的实现过程。
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