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预处理dataset产生的问题

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发表于 2024-11-3 12:17:11 | 显示全部楼层 |阅读模式

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x
def prepare_input(cfg, text):
    inputs = cfg.tokenizer.encode_plus(
        text,
        return_tensors=None,
        add_special_tokens=True,#自动在每个文本前后添加特殊标记(如CLS和SEP)
        return_attention_mask=True # 计算注意力(attention)时忽略那些paddle值
    )
    
    if len(inputs['input_ids']) > CFG.max_len:#句子长度大于max_length时截断
        inputs['input_ids'] = inputs['input_ids'][:CFG.max_len]
        inputs['attention_mask'] = inputs['attention_mask'][:CFG.max_len]
        inputs['token_type_ids'] = inputs['token_type_ids'][:CFG.max_len]

    for k, v in inputs.items():
        inputs[k] = torch.tensor(v, dtype=torch.long)
    return inputs


class LLMDataset(Dataset):
    def __init__(self, cfg, df,is_grad):
        self.cfg = cfg
        self.df = df
        self.texts = df["cleaned"].values
        self.is_grad = is_grad 

    def __len__(self):
        return len(self.texts)

    def __getitem__(self,idx,item):
        inputs = prepare_input(self.cfg, self.texts[item])
        
        
        if self.is_grad:#训练集
            labels = self.df.loc[idx]['label']
            # [batch,1,max_len(84)] -> [batch,max_len]#使用squeeze降维
            return {'input_ids':inputs['input_ids'].squeeze(),
                    'attention_mask':inputs['attention_mask'].squeeze(),
                    'token_type_ids':inputs['token_type_ids'].squeeze(),
                   # Our loss_fn wants it to be a "float" type
                    'labels':torch.tensor(labels,dtype=torch.float).unsqueeze(dim=0)}
        else:#测试集
            # [batch,1,max_len(84)] -> [batch,max_len]
            return {'input_ids':inputs['input_ids'].squeeze(),
                    'attention_mask':inputs['attention_mask'].squeeze(),
                   'token_type_ids':inputs['token_type_ids'].squeeze()}


class CollateCls:
    def __init__(self, cfg):
        self.tokenizer = cfg.tokenizer
        self.cfg = cfg
        
    def __call__(self, batch):
        output = dict()
        output["input_ids"] = [sample["input_ids"] for sample in batch]
        output["attention_mask"] = [sample["attention_mask"] for sample in batch]
        output["token_type_ids"] = [sample["token_type_ids"] for sample in batch]
        # calculate max token length of this batch
        batch_max = max([len(ids) for ids in output["input_ids"]])

        # add padding
        if self.tokenizer.padding_side == "right":
            output["input_ids"] = [
                list(s) + (batch_max - len(s)) * [self.tokenizer.pad_token_id]
                for s in output["input_ids"]
            ]
            output["attention_mask"] = [
                list(s) + (batch_max - len(s)) * [0] for s in output["attention_mask"]
            ]
            output["token_type_ids"] = [list(s) + (batch_max - len(s)) * [0] for s in output["token_type_ids"]]

        else:
            output["input_ids"] = [
                (batch_max - len(s)) * [self.tokenizer.pad_token_id] + list(s)
                for s in output["input_ids"]
            ]
            output["attention_mask"] = [
                (batch_max - len(s)) * [0] + list(s) for s in output["attention_mask"]
            ]
            output["token_type_ids"] = [(batch_max - len(s)) * [0] + list(s) for s in output["token_type_ids"]]
        
        
        # convert to tensors
        output["input_ids"] = torch.tensor(output["input_ids"], dtype=torch.long)
        output["attention_mask"] = torch.tensor(output["attention_mask"], dtype=torch.long)
        output["token_type_ids"] = torch.tensor(output["token_type_ids"], dtype=torch.long)
        
        return output

上述代码哪里有错误
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发表于 2024-11-3 12:17:30 | 显示全部楼层
在你提供的代码中,有几个地方可能存在问题:

1. **`prepare_input`函数中的重复代码**:
   - 在检查输入长度时,`inputs = inputs`重复了三次,应该是想要截断或处理输入,但没有实现。

2. **`__getitem__`方法中的索引问题**:
   - `self.texts`是一个数组,但在`prepare_input`中传入的是整个数组而不是单个文本。应该是`self.texts[idx]`。

3. **`__getitem__`方法中的`labels`获取**:
   - `labels = self.df.loc`不完整,应该指定行和列。可能是`labels = self.df.loc[idx, 'label_column_name']`。

4. **`CollateCls`类中的`output`处理**:
   - `output`的处理重复了三次,且缺少填充值。应该在`*`后面加上填充值,比如`self.tokenizer.pad_token_id`。

5. **`torch.tensor`转换重复**:
   - `torch.tensor(output, dtype=torch.long)`重复了三次,只需一次即可。

以下是一些修正建议:

- 在`prepare_input`中,处理输入长度的逻辑需要实现。
- 在`__getitem__`中,确保从`self.texts`中获取单个文本,并正确获取`labels`。
- 在`CollateCls`中,确保填充值正确,并只进行一次`torch.tensor`转换。

如果需要进一步的代码示例或详细解释,请告诉我。

以上回复来自 FishC AI 小助理,如未能正确解答您的问题,请继续追问。
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 楼主| 发表于 2024-11-3 12:38:44 | 显示全部楼层
FishC 发表于 2024-11-3 12:17
在你提供的代码中,有几个地方可能存在问题:

1. **`prepare_input`函数中的重复代码**:
---------------------------------------------------------------------------
KeyError                                  Traceback (most recent call last)
Cell In[118], line 4
      1 print('Training Start!')
      2 print('=' * 100)
----> 4 train(model,
      5     device,
      6     train_dataloader,
      7     valid_dataloader,
      8     CFG.epochs,
      9     loss_fn,
     10     optimizer,
     11     metric)
     13 del model,train_dataloader, valid_dataloader
     14 gc.collect()

Cell In[82], line 17, in train(model, device, train_dataloader, valid_dataloader, epochs, loss_fn, optimizer, metric)
     14 train_step = 0
     15 pbar = tqdm(train_dataloader)#tqdm参数是一个iterable
---> 17 for batch in pbar: # you can also write like "for batch in tqdm(train_dataloader"
     18     optimizer.zero_grad() # initialize
     19     train_step += 1

File /opt/conda/lib/python3.10/site-packages/tqdm/notebook.py:250, in tqdm_notebook.__iter__(self)
    248 try:
    249     it = super().__iter__()
--> 250     for obj in it:
    251         # return super(tqdm...) will not catch exception
    252         yield obj
    253 # NB: except ... [ as ...] breaks IPython async KeyboardInterrupt

File /opt/conda/lib/python3.10/site-packages/tqdm/std.py:1181, in tqdm.__iter__(self)
   1178 time = self._time
   1180 try:
-> 1181     for obj in iterable:
   1182         yield obj
   1183         # Update and possibly print the progressbar.
   1184         # Note: does not call self.update(1) for speed optimisation.

File /opt/conda/lib/python3.10/site-packages/torch/utils/data/dataloader.py:630, in _BaseDataLoaderIter.__next__(self)
    627 if self._sampler_iter is None:
    628     # TODO(https://github.com/pytorch/pytorch/issues/76750)
    629     self._reset()  # type: ignore[call-arg]
--> 630 data = self._next_data()
    631 self._num_yielded += 1
    632 if self._dataset_kind == _DatasetKind.Iterable and \
    633         self._IterableDataset_len_called is not None and \
    634         self._num_yielded > self._IterableDataset_len_called:

File /opt/conda/lib/python3.10/site-packages/torch/utils/data/dataloader.py:1344, in _MultiProcessingDataLoaderIter._next_data(self)
   1342 else:
   1343     del self._task_info[idx]
-> 1344     return self._process_data(data)

File /opt/conda/lib/python3.10/site-packages/torch/utils/data/dataloader.py:1370, in _MultiProcessingDataLoaderIter._process_data(self, data)
   1368 self._try_put_index()
   1369 if isinstance(data, ExceptionWrapper):
-> 1370     data.reraise()
   1371 return data

File /opt/conda/lib/python3.10/site-packages/torch/_utils.py:706, in ExceptionWrapper.reraise(self)
    702 except TypeError:
    703     # If the exception takes multiple arguments, don't try to
    704     # instantiate since we don't know how to
    705     raise RuntimeError(msg) from None
--> 706 raise exception

KeyError: Caught KeyError in DataLoader worker process 0.
Original Traceback (most recent call last):
  File "/opt/conda/lib/python3.10/site-packages/pandas/core/indexes/base.py", line 3805, in get_loc
    return self._engine.get_loc(casted_key)
  File "index.pyx", line 167, in pandas._libs.index.IndexEngine.get_loc
  File "index.pyx", line 196, in pandas._libs.index.IndexEngine.get_loc
  File "pandas/_libs/hashtable_class_helper.pxi", line 2606, in pandas._libs.hashtable.Int64HashTable.get_item
  File "pandas/_libs/hashtable_class_helper.pxi", line 2630, in pandas._libs.hashtable.Int64HashTable.get_item
KeyError: 2183

The above exception was the direct cause of the following exception:

Traceback (most recent call last):
  File "/opt/conda/lib/python3.10/site-packages/torch/utils/data/_utils/worker.py", line 309, in _worker_loop
    data = fetcher.fetch(index)  # type: ignore[possibly-undefined]
  File "/opt/conda/lib/python3.10/site-packages/torch/utils/data/_utils/fetch.py", line 52, in fetch
    data = [self.dataset[idx] for idx in possibly_batched_index]
  File "/opt/conda/lib/python3.10/site-packages/torch/utils/data/_utils/fetch.py", line 52, in <listcomp>
    data = [self.dataset[idx] for idx in possibly_batched_index]
  File "/tmp/ipykernel_31/2920046666.py", line 34, in __getitem__
    labels = self.df.loc[idx]['label']
  File "/opt/conda/lib/python3.10/site-packages/pandas/core/indexing.py", line 1191, in __getitem__
    return self._getitem_axis(maybe_callable, axis=axis)
  File "/opt/conda/lib/python3.10/site-packages/pandas/core/indexing.py", line 1431, in _getitem_axis
    return self._get_label(key, axis=axis)
  File "/opt/conda/lib/python3.10/site-packages/pandas/core/indexing.py", line 1381, in _get_label
    return self.obj.xs(label, axis=axis)
  File "/opt/conda/lib/python3.10/site-packages/pandas/core/generic.py", line 4301, in xs
    loc = index.get_loc(key)
  File "/opt/conda/lib/python3.10/site-packages/pandas/core/indexes/base.py", line 3812, in get_loc
    raise KeyError(key) from err
KeyError: 2183

以上为报错信息,相关代码如下
def prepare_input(cfg, text):
    inputs = cfg.tokenizer.encode_plus(
        text,
        return_tensors=None,
        add_special_tokens=True,#自动在每个文本前后添加特殊标记(如CLS和SEP)
        return_attention_mask=True # 计算注意力(attention)时忽略那些paddle值
    )
    
    if len(inputs['input_ids']) > CFG.max_len:#句子长度大于max_length时截断
        inputs['input_ids'] = inputs['input_ids'][:CFG.max_len]
        inputs['attention_mask'] = inputs['attention_mask'][:CFG.max_len]
        inputs['token_type_ids'] = inputs['token_type_ids'][:CFG.max_len]

    for k, v in inputs.items():
        inputs[k] = torch.tensor(v, dtype=torch.long)
    return inputs


class LLMDataset(Dataset):
    def __init__(self, cfg, df,is_grad):
        self.cfg = cfg
        self.df = df
        self.texts = df["cleaned"].values
        self.is_grad = is_grad 

    def __len__(self):
        return len(self.texts)

    def __getitem__(self,idx):
        inputs = prepare_input(self.cfg, self.texts[idx])#inputs是一个字典
        
        
        if self.is_grad:#训练集
            labels = self.df.loc[idx]['label']
            # [batch,1,max_len(84)] -> [batch,max_len]#使用squeeze降维
            return {'input_ids':inputs['input_ids'].squeeze(),
                    'attention_mask':inputs['attention_mask'].squeeze(),
                    'token_type_ids':inputs['token_type_ids'].squeeze(),
                   # Our loss_fn wants it to be a "float" type
                    'labels':torch.tensor(labels,dtype=torch.float).unsqueeze(dim=0)}
        else:#测试集
            # [batch,1,max_len(84)] -> [batch,max_len]
            return {'input_ids':inputs['input_ids'].squeeze(),
                    'attention_mask':inputs['attention_mask'].squeeze(),
                   'token_type_ids':inputs['token_type_ids'].squeeze()}


class CollateCls:
    def __init__(self, cfg):
        self.tokenizer = cfg.tokenizer
        self.cfg = cfg
        
    def __call__(self, batch):
        output = dict()
        output["input_ids"] = [sample["input_ids"] for sample in batch]
        output["attention_mask"] = [sample["attention_mask"] for sample in batch]
        output["token_type_ids"] = [sample["token_type_ids"] for sample in batch]
        # calculate max token length of this batch
        batch_max = max([len(ids) for ids in output["input_ids"]])

        # add padding
        if self.tokenizer.padding_side == "right":
            output["input_ids"] = [
                list(s) + (batch_max - len(s)) * [self.tokenizer.pad_token_id]
                for s in output["input_ids"]
            ]
            output["attention_mask"] = [
                list(s) + (batch_max - len(s)) * [0] for s in output["attention_mask"]
            ]
            output["token_type_ids"] = [list(s) + (batch_max - len(s)) * [0] for s in output["token_type_ids"]]

        else:
            output["input_ids"] = [
                (batch_max - len(s)) * [self.tokenizer.pad_token_id] + list(s)
                for s in output["input_ids"]
            ]
            output["attention_mask"] = [
                (batch_max - len(s)) * [0] + list(s) for s in output["attention_mask"]
            ]
            output["token_type_ids"] = [(batch_max - len(s)) * [0] + list(s) for s in output["token_type_ids"]]
        
        
        # convert to tensors
        output["input_ids"] = torch.tensor(output["input_ids"], dtype=torch.long)
        output["attention_mask"] = torch.tensor(output["attention_mask"], dtype=torch.long)
        output["token_type_ids"] = torch.tensor(output["token_type_ids"], dtype=torch.long)
        
        return output
#生成训练集
train_dataset = LLMDataset(CFG,pd.concat([X_train,y_train],axis=1),True)
valid_dataset = LLMDataset(CFG,pd.concat([X_valid,y_valid],axis=1),False)
from torch.utils.data import DataLoader

train_dataloader = DataLoader(train_dataset,batch_size=32,collate_fn=CollateCls(CFG),shuffle=True,num_workers = 4,pin_memory=True)#锁页内存(pin_memory)能够保持与GPU进行高速传输,在训练时加快数据的读取
valid_dataloader = DataLoader(valid_dataset,batch_size=32,collate_fn=CollateCls(CFG),shuffle=False,num_workers = 4,pin_memory=True)

#collate_fn用于自定义数据加载和批处理的方式
import gc,os
from tqdm.auto import tqdm # visualizing tool for progress

# They will be used to pick the best model.pt given to the valid loss
best_model_epoch, valid_loss_values = [],[] 
valid_loss_min = [1] # arbitrary loss I set here
def train(model,device,train_dataloader,valid_dataloader,epochs,loss_fn,optimizer,metric):

    for epoch in range(epochs):
        gc.collect() # memory cleaning垃圾回收机制,减少占用内存
        model.train()

        train_loss = 0
        train_step = 0
        pbar = tqdm(train_dataloader)#tqdm参数是一个iterable

        for batch in pbar: # you can also write like "for batch in tqdm(train_dataloader"
            optimizer.zero_grad() # initialize
            train_step += 1
            

            train_input_ids = batch['input_ids'].to(device)
            train_attention_mask = batch['attention_mask'].to(device)
            train_token_type_ids = batch['token_type_ids'].to(device)
            train_labels = batch['labels'].squeeze().to(device).long()#label真实值long()转化成一维张量
            
            # You can refer to the class "TweetsModel" for understand 
            # what would be logits
            logits = model(train_input_ids, train_attention_mask,train_token_type_ids).to(device)
            predictions = torch.argmax(logits, dim=1) # get an index from larger one
            detached_predictions = predictions.detach().cpu().numpy()
            
            loss = loss_fn(logits, train_labels)
            loss.backward() 
            optimizer.step()
            model.zero_grad()

            train_loss += loss.detach().cpu().numpy().item()

            pbar.set_postfix({'train_loss':train_loss/train_step})#设置进度条显示信息
        pbar.close()

        with torch.no_grad():
            model.eval()

            valid_loss = 0
            valid_step = 0
            total_valid_score = 0

            y_pred = [] # for getting f1_score that is a metric of the competition
            y_true = []

            pbar = tqdm(valid_dataloader)
            for batch in pbar:
                valid_step += 1

                valid_input_ids = batch['input_ids'].to(device)
                valid_attention_mask = batch['attention_mask'].to(device)
                valid_token_type_ids = batch['token_type_ids'].to(device)
                valid_labels = batch['labels'].squeeze().to(device).long()

                logits = model(valid_input_ids, valid_attention_mask).to(device)
                predictions = torch.argmax(logits, dim=1)
                detached_predictions = predictions.detach().cpu().numpy()
                
                loss = loss_fn(logits, valid_labels)
                valid_loss += loss.detach().cpu().numpy().item()

                y_pred.extend(predictions.cpu().numpy())
                y_true.extend(valid_labels.cpu().numpy())

            valid_loss /= valid_step
            f1 = f1_score(y_true,y_pred)

            print(f'Epoch [{epoch+1}/{epochs}] Score: {f1}')
            print(f'Epoch [{epoch+1}/{epochs}] Valid_loss: {valid_loss}')

            if valid_loss < min(valid_loss_min):
                print('model improved!')
            else:
                print('model not improved')
    
            torch.save(model.state_dict(), f'epoch:{epoch+1}_model.pt')#state_dict 是一个字典对象,包含了模型的所有可学习参数(如权重和偏置)及其当前值
            print('save checkpoint!')
            valid_loss_min.append(valid_loss)
            print(f'valid_loss_min:{min(valid_loss_min)}')

        best_model_epoch.append(f'/kaggle/working/epoch:{epoch+1}_model.pt')
        valid_loss_values.append(valid_loss)
        print('='*100)

    select_best_model() # refer to below function
    print('Train/Valid Completed!!')
    del train_dataloader, valid_dataloader # memory cleaning
    gc.collect()

def select_best_model():
    best_model = best_model_epoch[np.array(valid_loss_values).argmin()]
    os.rename(best_model, best_model.split('.pt')[0] + '_best.pt')#重命名文件
print('Training Start!')
print('=' * 100)

train(model,
    device,
    train_dataloader,
    valid_dataloader,
    CFG.epochs,
    loss_fn,
    optimizer,
    metric)

del model,train_dataloader, valid_dataloader
gc.collect()
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发表于 2024-11-3 12:38:56 | 显示全部楼层
Terence888 发表于 2024-11-03 12:38
-------------------------------------------------- ...


根据错误信息和代码,以下是可能导致`KeyError`的原因和解决方案:

1. **`__getitem__`方法中的索引问题**:
   - 在`LLMDataset`类的`__getitem__`方法中,`labels = self.df.loc`不完整。你需要指定行和列。应该是`labels = self.df.loc[idx, 'label_column_name']`,其中`'label_column_name'`是你数据框中标签列的名称。

2. **`prepare_input`函数中的输入问题**:
   - `prepare_input`函数中,`self.texts`传入的是整个数组而不是单个文本。应该是`self.texts[idx]`。

3. **`CollateCls`类中的填充值**:
   - 在`CollateCls`类中,填充值缺失。你需要在`*`后面加上填充值,比如`self.tokenizer.pad_token_id`。

4. **数据集的创建**:
   - 在创建`train_dataset`和`valid_dataset`时,`pd.concat(,axis=1)`缺少参数。你需要传入要合并的DataFrame列表。

5. **`train`函数中的数据处理**:
   - 在`train`函数中,`batch`是一个字典,你需要从中提取`input_ids`、`attention_mask`、`token_type_ids`和`labels`。例如:`train_input_ids = batch['input_ids'].to(device)`。

以下是一些修正建议:

- 确保在`__getitem__`中正确获取单个文本和标签。
- 在`CollateCls`中,确保填充值正确。
- 在`train`函数中,从`batch`字典中提取正确的张量。

如果需要进一步的代码示例或详细解释,请告诉我。

以上回复来自 FishC AI 小助理,如未能正确解答您的问题,请继续追问。
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