求高手求高手求高手---按规律合并三个文件

冬天的哈根达斯 · 发表于 2016-2-18 20:31:54

hldh214 发表于 2016-2-18 16:53
origin target 是两个列表, 用for迭代出了each 传入两个列表, 你那个不行是因为换行符, 你给每个文件末尾 ...

但是这个输出的结果，跟我题目要的结果不一样

hldh214 · 发表于 2016-2-18 20:33:10

冬天的哈根达斯发表于 2016-2-18 20:31
但是这个输出的结果，跟我题目要的结果不一样

冬雪雪冬 · 发表于 2016-2-19 10:05:18

把题目简化了一下，文件改为列表。
另零值没有改为'.'

list1 = [['a1', 11, 'A', 0,286],
['a1', 21, 'CG', 13, 44],
['a1', 23, 'C', 52, 15],
['a1', 24, 'AG', 68, 14],
['a1', 36, 'AG', 59, 12]]
list2 = [['a1', 11, 'A', 0, 130],
['a1', 21, 'CG', 13, 47],
['a1', 23, 'C', 47, 12],
['a1', 24, 'AG', 35, 20],
['a1', 32, 'C', 38, 41],
['a1', 33, 'A', 81, 13],
['a1', 36, 'AG', 65, 18],
['a1', 37, 'CT', 72, 11]]
list3 = [['a1', 11, 'A', 0, 264],
['a1', 21, 'CG', 37, 23],
['a1', 32, 'C', 34, 29],
['a1', 33, 'A', 51, 14],
['a1', 34, 'CT', 54, 7],
['a1', 36, 'AG', 54, 6]]
list4 = []
j = 0
for i in range(100):#假定列表第二列的范围在此之内
if i in list(zip(*list1))[1] or i in list(zip(*list2))[1] or i in list(zip(*list3))[1]:
#判断i是否在三个列表的第二列中，list(zip(*list1))是将列表转置
list4.append([])
list4[j].extend(['a1', i])
for l1 in list1:
if i == l1[1]:
list4[j].extend(l1[2:])
break
else:
list4[j].extend(['.', '.', '.'])
for l2 in list2:
if i == l2[1]:
list4[j].extend(l2[2:])
break
else:
list4[j].extend(['.', '.', '.'])
for l3 in list3:
if i == l3[1]:
list4[j].extend(l3[2:])
break
else:
list4[j].extend(['.', '.', '.'])
j += 1
for i in list4:
print(i)

复制代码

输出

['a1', 11, 'A', 0, 286, 'A', 0, 130, 'A', 0, 264]
['a1', 21, 'CG', 13, 44, 'CG', 13, 47, 'CG', 37, 23]
['a1', 23, 'C', 52, 15, 'C', 47, 12, '.', '.', '.']
['a1', 24, 'AG', 68, 14, 'AG', 35, 20, '.', '.', '.']
['a1', 32, '.', '.', '.', 'C', 38, 41, 'C', 34, 29]
['a1', 33, '.', '.', '.', 'A', 81, 13, 'A', 51, 14]
['a1', 34, '.', '.', '.', '.', '.', '.', 'CT', 54, 7]
['a1', 36, 'AG', 59, 12, 'AG', 65, 18, 'AG', 54, 6]
['a1', 37, '.', '.', '.', 'CT', 72, 11, '.', '.', '.']

复制代码

冬天的哈根达斯 · 发表于 2016-2-24 10:21:31

冬雪雪冬发表于 2016-2-19 10:05
把题目简化了一下，文件改为列表。
另零值没有改为'.'

几天没来了，刚看到，十分感谢！

冬天的哈根达斯 · 发表于 2016-2-26 11:04:26

本帖最后由冬天的哈根达斯于 2016-2-26 11:33 编辑

冬雪雪冬发表于 2016-2-19 10:05
把题目简化了一下，文件改为列表。
另零值没有改为'.'

文件1.txt内容如下：
a1,11,A , 0 ,286
a1,21,CG,13,44
a1,23,C,52,15
a1,24,AG,68,14
a1,36,AG,59,12

list1 = [['a1', 11, 'A', 0,286],
      ['a1', 21, 'CG', 13, 44],
      ['a1', 23, 'C', 52, 15],
      ['a1', 24, 'AG', 68, 14],
      ['a1', 36, 'AG', 59, 12]]
如何把1.txt的文件输入成list1.

冬雪雪冬 · 发表于 2016-2-26 11:31:04

本帖最后由冬雪雪冬于 2016-2-26 11:33 编辑

冬天的哈根达斯发表于 2016-2-26 11:04
文件1.txt内容如下：
a       b       c       d       e
a1    ...

你看看这个行不行，不过数字也当成了字符串。

f1 = open('1.txt')
list1 = []
j = 0
for i in f1:
list1.append([])
i = i.strip('\n')
list1[j] = i.split()
j += 1
f1.close()

复制代码

结果：

[['a', 'b', 'c', 'd', 'e'], ['a1', '1', 'A', '0', '286'], ['a1', '2', 'CG', '13', '44'], ['a1', '3', 'C', '52', '15'], ['a1', '4', 'AG', '68', '14'], ['a1', '6', 'AG', '59', '12']]

复制代码

冬天的哈根达斯 · 发表于 2016-2-26 11:41:41

冬雪雪冬发表于 2016-2-26 11:31
你看看这个行不行，不过数字也当成了字符串。

我修改了一下问题，然后用你的方法不行，麻烦你再看看

冬雪雪冬 · 发表于 2016-2-26 13:42:56

冬天的哈根达斯发表于 2016-2-26 11:41
我修改了一下问题，然后用你的方法不行，麻烦你再看看

只需把07行改为：

list1[j] = i.split(',')

复制代码

冬天的哈根达斯 · 发表于 2016-3-1 14:03:11

冬雪雪冬发表于 2016-2-26 13:42
只需把07行改为：

文件1.txt内容如下：
chr1,69511,A,G,0,286,G/G,7679.77,
chr1,861368,CG,C,13,44,CG/C,1143.73,
chr1,861376,C,CG,52,15,C/CG,113.73,
chr1,861461,AG,A,68,14,AG/A,19.78,
chr1,865773,AG,A,59,12,AG/A,242.73,
chr1,871288,AG,A,11,9,AG/A,75.73,
chr1,871334,G,T,18,26,G/T,775.77,
chr1,874412,TC,T,11,9,TC/T,94.73,
chr1,874519,TG,T,41,8,TG/T,17.8,
chr1,874553,G,GA,7,4,G/GA,11.08,
chr1,874769,AC,A,11,8,AC/A,107.73,
chr1,876480,AG,A,10,6,AG/A,54.73,
chr1,876499,A,G,0,11,G/G,189.77,
chr1,876565,AG,A,2,5,AG/A,41.74,
chr1,876647,AG,A,107,22,AG/A,70.73,
chr1,877715,C,G,0,7,G/G,113.81,
chr1,878445,A,AC,72,20,A/AC,51.73,
############################################################################################分割线
x1 = open('F:/1.txt').readlines()

lis1= [ ]
j = 0

for i in x1:
lis1.append([ ])
i = i.strip('\n')
lis1[j] = i.split(',')
j += 1

for i in lis1: #我想在这里面直接用lis1可不可以？
print(i[1])

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