鱼C论坛

 找回密码
 立即注册
查看: 1346|回复: 2

如何根据b文件来筛选掉不想要的domain

[复制链接]
发表于 2018-1-31 20:55:00 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,享用更多功能^_^

您需要 登录 才可以下载或查看,没有账号?立即注册

x
a.txt
super1_35231_42804      7574    gag_pre-integrs/RVT_2/Retrotran_gag_2/rve
super1_48918_54312      5395    Retrotran_gag_2/gag_pre-integrs/rve/RVT_2
super1_71681_76173      4493    Retrotran_gag_2
super1_192233_199678    7446    Retrotrans_gag/Asp_protease_2/gag-asp_proteas/RVP_2/RVT_1/rve/Chromo
super1_216492_223313    6822    Retrotrans_gag
super1_230561_235028    4468    Retrotran_gag_2/zf-CCHC/zf-CCHC_4
super1_291428_302513    11086   Retrotrans_gag/RVP_2/RVT_1/rve

b.txt
Chromo
Retrotran_gag_2
Retrotran_gag_3
zf-CCHC
zf-CCHC_2
zf-CCHC_4
Transposase_28
如上,a 文件包含3列:序列,长度,由/分开的domain         b文件是我想要的domain
问题:我如何根据b文件来筛选掉不想要的domain
小甲鱼最新课程 -> https://ilovefishc.com
回复

使用道具 举报

发表于 2018-1-31 21:07:55 | 显示全部楼层
添加个判断?
小甲鱼最新课程 -> https://ilovefishc.com
回复 支持 反对

使用道具 举报

发表于 2018-1-31 21:09:55 | 显示全部楼层
a文件按行读取, b文件也按行读取,对于b文件的每一行,用in判断是否在a文件的某行里,如果a文件的这行不包含b文件的任意一行,则输出到新文件c中,总共是b*a的时间复杂度,创建了新文件c
小甲鱼最新课程 -> https://ilovefishc.com
回复 支持 反对

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

小黑屋|手机版|Archiver|鱼C工作室 ( 粤ICP备18085999号-1 | 粤公网安备 44051102000585号)

GMT+8, 2025-8-28 22:02

Powered by Discuz! X3.4

© 2001-2023 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表